凝膠遷移實驗EMSA/EMSA 蛋白質可以與末端標記的核酸探針結合，在瓊脂糖膠或非變性膠中電泳時這種複合物比無蛋白結合的探針在凝膠中泳動的速度慢，即表現為相對滯後。該方法可用於檢測DNA結合蛋白、RNA結合蛋白，並可通過加入特異性的抗體（supershift）來檢測特定的蛋白質，進行未知蛋白的鑒定。